SEQanswers

Go Back   SEQanswers > Sequencing Technologies/Companies > Illumina/Solexa



Similar Threads
Thread Thread Starter Forum Replies Last Post
Changing index read length for Miseq run WinterIsComing Illumina/Solexa 2 01-11-2019 09:27 AM
Pooling TruSeq (single index) and Nextera XT (dual index) in one MiSeq run? Carosmile Sample Prep / Library Generation 1 05-16-2017 01:13 PM
MiSeq Run, Problem with Index reads spf2 Illumina/Solexa 6 08-24-2015 06:59 AM
MiSeq Index Read PTW Illumina/Solexa 4 01-23-2013 09:24 AM
Changing the read length after the run had started hfaoro SOLiD 1 06-27-2011 11:18 AM

Reply
 
Thread Tools
Old 09-21-2019, 01:39 AM   #1
huatrongkhang
Junior Member
 
Location: vietnam

Join Date: Sep 2019
Posts: 1
Default Changing index read length for Miseq run

Trong các căn hộ gia đ́nh, bể phốt chính là nơi tập trung các chất thải sinh hoạt để xử lư, là chỗ đến cuối cùng của những đường ống dẫn chất thải, do đó phải được đặt bố trí tại các vị trí hợp lư. Nhiều người có cùng thắc mắc*có nên đặt bể phốt dưới bếp*hay không? Hăy cùng t́m hiểu câu trả lời thông qua bài viết ngắn sau đây.

>>> Các bạn xem thêm về*dịch vụ hút bể phốt tại Ba Đ́nh avico : https://hutbephottaihanoi.vn/hut-be-phot-tai-ba-dinh/

Có nên đặt bể phốt dưới bếp hay không?

Nhiều người lựa chọn vị trí bếp để làm nơi xây dựng bể phốt. Tuy nhiên điều này là không nên cả về phong thủy vừa dễ gây nguy hiểm cho* người dùng nếu chẳng may có t́nh trạng hỏng hóc, hư hại xảy ra. Bể phốt là nơi chứa đựng các chất thải, nhiều chất uế nhất, do đó không nên xây dựng ngay dưới căn bếp - nơi nấu nướng những bữa cơm gia đ́nh ấm úng, có nhiều nhà thờ ông* bếp linh thiêng, không thể nào bố trí được điều đó.


Là công ty chuyên đi xử lư các trường hợp về bể phốt, chúng tôi khuyên bạn nên xây bể phốt tại những nơi có vị trí bằng phẳng, không quá dốc để tránh trường hợp các ống dẫn bị bể, bị tắc hoặc gặp những vấn đề khác.

Cụ thể, nhiều hộ gia đ́nh lựa chọn xây bể phốt tại vị trí bên dưới cầu thang. Vị trí này sẽ giúp bạn tiết kiệm được không gian ngôi nhà, vừa giảm thiểu được độ hư hại rủi ro có thể xảy ra với đường ống dẫn nước thải, lại không làm ảnh hưởng đến tốc độ cũng như đường chuyền của ḍng chảy do thiết kế vị trí có khúc gấp hoặc ngoằn nghèo.

>>> Mời các bạn xem thêm về dịch vụ hút bể phốt tại cầu giấy avico : https://hutbephottaihanoi.vn/hut-be-phot-tai-cau-giay/

Xử lư bể phốt với dịch vụ của công ty hút bể phốt Avico

Là một trong những công ty dịch vụ được người dùng đánh giá cao nhất hiện nay, công ty*số điện thoại hút bể phốt*Avico luôn mang đến sứ mênh cao ca cho khách hàng, không lạc đường không mất nhiều thời gian như các cửa hàng khác.

Với dịch vụ của công ty, với việc có nên đặt bể phốt dưới bếp hay không nay là một câu trả lời quá đơn giản và đầy sự logic và thuyết phục. Nếu trong gia đ́nh bạn chẳng may gặp rắc rối về vấn đề bể phốt, hăy liên hệ ngay với công ty hút bể phốt Avico chúng tôi qua tổng đài chăm sóc khách hàng 0984 706 622 hoặc email*hutbephotavico@gmail.com*để được tư vấn và hỗ trợ chi tiết hơn nhé

Thông tin liên hệ công ty Hút bể phốt AVICO

Địa chỉ VP : Số 287 Nguyễn Trăi, Thanh Xuân, TP. Hà Nội

Email công ty : hutbephotavico@gmail.com

Website : hutbephotaihanoi.vn

Hotline : 0984.706.622

Last edited by huatrongkhang; 10-02-2019 at 02:27 AM.
huatrongkhang is offline   Reply With Quote
Old 09-21-2019, 06:24 AM   #2
GenoMax
Senior Member
 
Location: East Coast USA

Join Date: Feb 2008
Posts: 6,978
Default

It is an odd request but it should be possible. Someone one on experimental side will chip in to confirm.

On informatics side you will need make sure the SampleSheet is correctly set up. No special code would be needed.

I hope you know exactly what you are doing on experimental side of things.

Last edited by GenoMax; 09-30-2019 at 05:39 AM.
GenoMax is offline   Reply With Quote
Old 09-30-2019, 05:34 AM   #3
pmiguel
Senior Member
 
Location: Purdue University, West Lafayette, Indiana

Join Date: Aug 2008
Posts: 2,315
Default

[Note added after writing post: this exact same question, using the same wording was posted previously:

http://seqanswers.com/forums/showthread.php?t=86749

Why?]

Right, you just put the index sequences in the sample sheet and the index read(s) will be that long.

Keep in mind that MiSeq cassettes are only provisioned for 2 eight base indexes + the insert reads. So if you want 25 base index reads you will be 50-16=34 cycles over the total number of cycles in the cassette if you try to run the full number of cycles.

That is, if you have a 300 cycle cassette, enough reagents are provided to do 302 + 16 cycles = 318. (Ignoring the dark cycles needed for i5 indexing...) So if you want 50 cycles of indexes, the extra 34 cycles has to come out of your insert reads. So instead of 302 cycles, you would have 276 cycles to split between your two insert reads.

I should note that I haven't ever tried to do this, I'm just going from first principles. So there might be issues. For example the MiSeq might have a maximum index length that I'm unaware of.


--
Phillip
pmiguel is offline   Reply With Quote
Reply

Thread Tools

Posting Rules
You may not post new threads
You may not post replies
You may not post attachments
You may not edit your posts

BB code is On
Smilies are On
[IMG] code is On
HTML code is Off




All times are GMT -8. The time now is 01:18 PM.


Powered by vBulletin® Version 3.8.9
Copyright ©2000 - 2019, vBulletin Solutions, Inc.
Single Sign On provided by vBSSO