I don't know if anyone here has used Variation-Hunter.
I used the *.vh files generated from mrFAST as the input of Variation-Hunter.
But it seems I only get empty output.
Anyone has any idea about that?
thx
I used the *.vh files generated from mrFAST as the input of Variation-Hunter.
But it seems I only get empty output.
Code:
15M ERR001269_110_output_DIVET.vh 8.0K ERR001269_110_output_DIVET.vh.Chr1 8.0K ERR001269_110_output_DIVET.vh.Chr10 8.0K ERR001269_110_output_DIVET.vh.Chr10.RR_FF 8.0K ERR001269_110_output_DIVET.vh.Chr11 8.0K ERR001269_110_output_DIVET.vh.Chr11.RR_FF 8.0K ERR001269_110_output_DIVET.vh.Chr12 8.0K ERR001269_110_output_DIVET.vh.Chr12.RR_FF 8.0K ERR001269_110_output_DIVET.vh.Chr13 8.0K ERR001269_110_output_DIVET.vh.Chr13.RR_FF 8.0K ERR001269_110_output_DIVET.vh.Chr14 8.0K ERR001269_110_output_DIVET.vh.Chr14.RR_FF 8.0K ERR001269_110_output_DIVET.vh.Chr15 8.0K ERR001269_110_output_DIVET.vh.Chr15.RR_FF 8.0K ERR001269_110_output_DIVET.vh.Chr16 8.0K ERR001269_110_output_DIVET.vh.Chr16.RR_FF 8.0K ERR001269_110_output_DIVET.vh.Chr17 8.0K ERR001269_110_output_DIVET.vh.Chr17.RR_FF 8.0K ERR001269_110_output_DIVET.vh.Chr18 8.0K ERR001269_110_output_DIVET.vh.Chr18.RR_FF 8.0K ERR001269_110_output_DIVET.vh.Chr19 8.0K ERR001269_110_output_DIVET.vh.Chr19.RR_FF 8.0K ERR001269_110_output_DIVET.vh.Chr1.RR_FF 8.0K ERR001269_110_output_DIVET.vh.Chr2 8.0K ERR001269_110_output_DIVET.vh.Chr20 8.0K ERR001269_110_output_DIVET.vh.Chr20.RR_FF 8.0K ERR001269_110_output_DIVET.vh.Chr21 8.0K ERR001269_110_output_DIVET.vh.Chr21.RR_FF 8.0K ERR001269_110_output_DIVET.vh.Chr22 8.0K ERR001269_110_output_DIVET.vh.Chr22.RR_FF 8.0K ERR001269_110_output_DIVET.vh.Chr23 8.0K ERR001269_110_output_DIVET.vh.Chr23.RR_FF 8.0K ERR001269_110_output_DIVET.vh.Chr24 8.0K ERR001269_110_output_DIVET.vh.Chr24.RR_FF 8.0K ERR001269_110_output_DIVET.vh.Chr2.RR_FF 8.0K ERR001269_110_output_DIVET.vh.Chr3 8.0K ERR001269_110_output_DIVET.vh.Chr3.RR_FF 8.0K ERR001269_110_output_DIVET.vh.Chr4 8.0K ERR001269_110_output_DIVET.vh.Chr4.RR_FF 8.0K ERR001269_110_output_DIVET.vh.Chr5 8.0K ERR001269_110_output_DIVET.vh.Chr5.RR_FF 8.0K ERR001269_110_output_DIVET.vh.Chr6 8.0K ERR001269_110_output_DIVET.vh.Chr6.RR_FF 8.0K ERR001269_110_output_DIVET.vh.Chr7 8.0K ERR001269_110_output_DIVET.vh.Chr7.RR_FF 8.0K ERR001269_110_output_DIVET.vh.Chr8 8.0K ERR001269_110_output_DIVET.vh.Chr8.RR_FF 8.0K ERR001269_110_output_DIVET.vh.Chr9 8.0K ERR001269_110_output_DIVET.vh.Chr9.RR_FF 8.0K ERR001269_110_output_DIVET.vh.FullChr.RR_FF 7.9M ERR001269_110_output_DIVET.vh.Name.Edit.Prob 104K ERR001269_110_output_DIVET.vh.Name.MinEdit.TotalProb 13M ERR001269_110_output_DIVET.vh.Prob.Clean 15M ERR001269_110_output_DIVET.vh.Prob.Full 16K ERR001269_110_output_DIVET.vh.SV 8.0K ERR001269_110_output_DIVET.vh.SV.Deletion 8.0K ERR001269_110_output_DIVET.vh.SV.Insertion 8.0K ERR001269_110_output_DIVET.vh.SV.Inversion
thx